法律分析：1、两者的保障对象和缴费主体不同

综合保险是为外来务工人员设立的一种新型保险制度，根据规定凡在本市(如上海)经商、务工但又不具有本市常住户籍的外来人员，都应该参加综合保险。

而本市城镇人口，则一般参保的社会保险，其次综合保险是由单位或个人缴纳保险费用，而社保则是用人单位和个人按照一定的缴费基数和比例共同缴纳。

2、两者的保障内容不同

综合保险包括工伤(含意外伤害)、住院治疗以及老年补助三方面的保险待遇；而社保保障内容更多，具体包括养老保险、医疗保险、失业保险、生育保险以及工伤保险，还有赔偿金额上，综合保险和社保也存在明显的区别，应综合保险赔偿标准。

3、两者缴纳费用的时间不相同

综合保险费的缴纳以三个月为一个周期，每次应当缴纳三个月的综合保险费。社保是单位在办理好以后，每个月按照规定的缴费比例和基数进行缴纳，缴纳具体的时间由所在地社保缴纳时间为主。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》

第二条 国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。

第三条 社会保险制度坚持广覆盖、保基本、多层次、可持续的方针，社会保险水平应当与经济社会发展水平相适应。

第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。

个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。

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